હેઇલોંગજિયાંગમાં ઉંદર "પેથોજન બેંક" નું અનાવરણ: લસ્સા અને હંટાવાયરસ સહિત મુખ્ય પેથોજેન્સની શોધ

તાજેતરના મેટાજેનોમિક અભ્યાસમાં હેઇલોંગજિયાંગ પ્રાંતમાં ઉંદરો દ્વારા વહન કરાયેલા વાયરસ અને બેક્ટેરિયાના નોંધપાત્ર વૈવિધ્યસભર સ્પેક્ટ્રમનો ખુલાસો થયો છે, જેમાં લાસા વાયરસ, અમુર વાયરસ, સાલ્મોનેલા અને યર્સિનિયા પેસ્ટિસનો સમાવેશ થાય છે.

સંશોધનમાં આનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતોમેક્રો અને માઇક્રો-ટેસ્ટમાંથી પેથોજેન આરએનએ એનરિચમેન્ટ કીટ, પ્રોબ કેપ્ચર ટેકનોલોજી પર આધારિત. હોસ્ટ rRNA અને અન્ય સંરક્ષિત હોસ્ટ ટુકડાઓને પસંદગીયુક્ત રીતે ઘટાડીને, પદ્ધતિએ અસરકારક રીતે માઇક્રોબાયલ RNA જાળવી રાખ્યું, જેનાથી પેથોજેન શોધ સંવેદનશીલતામાં નોંધપાત્ર સુધારો થયો. આ પેથોજેન RNA સંવર્ધન પગલું ઉચ્ચ શોધ દર પ્રાપ્ત કરવા માટે મહત્વપૂર્ણ હતું અને પેથોજેન સર્વેલન્સ માટે મજબૂત તકનીકી સહાય પૂરી પાડી હતી.

ઉંદરો: ઝૂનોટિક રોગોના મુખ્ય જળાશયો

ઉંદરો સસ્તન પ્રાણીઓનો સૌથી વધુ પ્રજાતિઓથી સમૃદ્ધ અને વ્યાપકપણે વિતરિત જૂથ છે, જેમાં વિશ્વભરમાં 2,000 થી વધુ પ્રજાતિઓનો સમાવેશ થાય છે અને તે તમામ સસ્તન પ્રાણીઓની પ્રજાતિઓના 40% થી વધુ હિસ્સો ધરાવે છે.

તેમના પર્યાવરણીય મહત્વ ઉપરાંત, ઉંદરો અસંખ્ય ઝૂનોટિક રોગકારક જીવાણુઓના મુખ્ય જળાશયો અને વાહક તરીકે સેવા આપે છે.ઉંદરોના રહેઠાણો વારંવાર માનવ વાતાવરણ સાથે ઓવરલેપ થાય છે - સીધા કરડવાથી, મળમૂત્રના સંપર્કમાં આવવાથી, અથવા ચાંચડ અને જીવાત દ્વારા પરોક્ષ ટ્રાન્સમિશન દ્વારા - તેઓ જે રોગકારક જીવાણુઓ ધરાવે છે તે સતત જાહેર આરોગ્ય માટે જોખમો પેદા કરે છે.

નોંધનીય છે કે, 70% થી વધુ ઉભરતા ચેપી રોગો વન્યજીવનમાંથી ઉદ્ભવે છે, જેમાં ઉંદરો સૌથી મહત્વપૂર્ણ વાયરલ જળાશયોમાંના એકનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે.

હેઇલોંગજિયાંગ સરહદી પ્રદેશ: પેથોજેન સર્વેલન્સ માટે એક અગ્રિમ હરોળ

ઉત્તરપૂર્વીય ચીનમાં એક સરહદી પ્રાંત, હેઇલોંગજિયાંગ, વિપુલ પ્રમાણમાં ઇકોલોજીકલ સંસાધનો ધરાવે છે અને અનેક દેશો સાથે સરહદો વહેંચે છે. સમૃદ્ધ જૈવવિવિધતા અને વારંવાર સરહદ પાર વસ્તીની હિલચાલનું સંયોજન રોગકારક સંક્રમણ માટે અનુકૂળ પરિસ્થિતિઓ બનાવે છે.

જૂન અને જુલાઈ 2021 ની વચ્ચે, સંશોધકોએ મુદાનજિયાંગ શહેરના હેંગદાઓહેઝી ટાઉનમાંથી 67 જંગલી ઉંદરો એકત્રિત કર્યા. નમૂનાઓમાં શામેલ છે:

l ૨૦એપોડેમસ પેનિનસુલા

એલ ૪૭માયોડ્સ રુફોકેનસ

બધા નમૂનાઓ રહેણાંક વિસ્તારો અને આસપાસના ખેતરોમાં કેદ કરવામાં આવ્યા હતા, જે માનવ વસાહતો અને વન્યજીવન નિવાસસ્થાનો વચ્ચેના ગાઢ સંબંધને પ્રકાશિત કરે છે.

પેથોજેન સંવર્ધન ટેકનોલોજી: યજમાન પૃષ્ઠભૂમિ હસ્તક્ષેપને દૂર કરવો

મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગમાં, હોસ્ટ આરએનએ સામાન્ય રીતે સિક્વન્સિંગ રીડ્સ પર પ્રભુત્વ ધરાવે છે, ઓછા-વિપુલતાવાળા પેથોજેન સિગ્નલોને છુપાવે છે.

આ પડકારનો સામનો કરવા માટે, અભ્યાસમાંમેક્રો અને માઇક્રો-ટેસ્ટની પેથોજેન મેટાજેનોમિક ડિટેક્શન કીટ. પ્રોબ કેપ્ચર ટેકનોલોજીનો ઉપયોગ કરીને, ખાસ ડિઝાઇન કરાયેલા પ્રોબ્સ હોસ્ટ rRNA અને સંરક્ષિત સિક્વન્સ સાથે જોડાય છે, જે તેમના અવક્ષયને સક્ષમ બનાવે છે અને તેના દ્વારા માઇક્રોબાયલ RNA ને સમૃદ્ધ બનાવે છે.

આ અભિગમથી રોગકારક શોધ સંવેદનશીલતામાં નોંધપાત્ર સુધારો થયો, જેનાથી ડાઉનસ્ટ્રીમ સિક્વન્સિંગને રોગકારક વાંચનના ઊંચા પ્રમાણને પુનઃપ્રાપ્ત કરવાની મંજૂરી મળી. સંવર્ધન પગલાએ ઉંદરો દ્વારા વહન કરાયેલ રોગકારક સ્પેક્ટ્રમને સચોટ રીતે દર્શાવવા માટે મજબૂત પાયો નાખ્યો.

સંવર્ધન પછી, RNA નમૂનાઓ રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શન, લાઇબ્રેરી બાંધકામ અને હાઇ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગમાંથી પસાર થયા. બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણમાં શામેલ છે:

l હોસ્ટ જીનોમ ફિલ્ટરિંગ

ક્રેકેન2 નો ઉપયોગ કરીને વર્ગીકરણ વર્ગીકરણ

l બ્રેકન સાથે વિપુલતા સુધારણા

આ કાર્યપ્રવાહથી વાયરલ અને બેક્ટેરિયલ સમુદાયોની વ્યાપક પ્રોફાઇલ તૈયાર થઈ.

સંશોધન તારણો: બહુવિધ વાયરસ અને બેક્ટેરિયાનું સહ-પરિભ્રમણ

વાયરલ તારણો

શોધાયેલા વાયરસ 21 વાયરલ પરિવારોના હતા, જેમાં શામેલ છેએરેનાવિરિડેઅનેહંટાવિરિડે.

દ્વારાનવીનતામેગાહિટનો ઉપયોગ કરીને એસેમ્બલી કરીને, 154 વાયરલ કોન્ટિગ્સ જનરેટ કરવામાં આવ્યા હતા, જેમાંથી 110 આઠ પરિવારોના 19 વાયરસ સાથે જોડાયેલા હતા.

In એપોડેમસ પેનિનસુલા, નીચેના વાયરસ ઓળખાયા:

l એરેનાવાયરસ: લસા વાયરસ, વેન્ઝોઉ વાયરસ, ગેરો વાયરસ

l હંટાવાયરસ: અમુર વાયરસ, પુમાલા વાયરસ

In માયોડ્સ રુફોકેનસ, ઉંદર ધમની વાયરસ અને અમુર વાયરસ મળી આવ્યા હતા.

આ રોગકારક જીવાણુઓમાં:

લસ્સા વાયરસ વાયરલ હેમોરહેજિક તાવનું કારણભૂત એજન્ટ છે, જેમાં મૃત્યુ દર આશરે 20% સુધી પહોંચે છે.

l અમુર વાયરસ એ હેમોરહેજિક તાવ અને રેનલ સિન્ડ્રોમ (HFRS) માટે જવાબદાર રોગકારક જીવાણુઓમાંનો એક છે. ચીનમાં હંટાવાયરસ ચેપનો સૌથી વધુ વૈશ્વિક બોજ નોંધાય છે.

બેક્ટેરિયલ તારણો

કુલ ૧,૦૫૧ બેક્ટેરિયલ જાતિઓની ટીકા કરવામાં આવી હતી.

સૌથી વધુ વિપુલ પ્રમાણમાં જાતિઓ હતી:

એલસૅલ્મોનેલા(૨૬–૩૧%)

એલયર્સિનિયા(૧૧-૨૩%)

સૅલ્મોનેલાએક મુખ્ય ખોરાકજન્ય રોગકારક જીવાણુ છે, જે વિશ્વભરમાં વાર્ષિક ધોરણે ટાઇફોઇડ તાવના 9 મિલિયન કેસ અને આશરે 110,000 મૃત્યુ માટે જવાબદાર છે.

યર્સિનિયા પેસ્ટિસપ્લેગનું કારક એજન્ટ, ત્રણ ઐતિહાસિક રોગચાળા માટે જવાબદાર રહ્યું છે. હેઇલોંગજિયાંગ પ્રાંતને ચીનના કુદરતી પ્લેગ કેન્દ્રોમાંના એક તરીકે ઓળખવામાં આવે છે અને તે પ્લેગ સર્વેલન્સ માટે પ્રાથમિકતા ધરાવતો પ્રદેશ છે.

અભ્યાસનું મહત્વ

વૈજ્ઞાનિક યોગદાન

આ અભ્યાસ હેઇલોંગજિયાંગના ઉંદરોમાં લાસા વાયરસના ટુકડા અને ઉંદર ધમનીના વાયરસના પ્રથમ અહેવાલનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે, જે ચીનના ઉંદર-જન્ય રોગકારક ડેટાબેઝનું વિસ્તરણ કરે છે.

તે સ્થાનિક ઉંદરોની વસ્તીમાં વાયરલ અને બેક્ટેરિયલ સમુદાયોને વ્યવસ્થિત રીતે વર્ગીકૃત કરે છે, જે સરહદી પ્રદેશોમાં ઝૂનોટિક રોગ દેખરેખ માટે મૂળભૂત ડેટા પ્રદાન કરે છે.

જાહેર આરોગ્ય અસરો

આ તારણો સતત દેખરેખ અને રોગકારક તપાસની જરૂરિયાત પર ભાર મૂકે છેA. દ્વીપકલ્પઅનેએમ. રુફોકેનસ.

આ ડેટા રેનલ સિન્ડ્રોમ સાથે પ્લેગ અને હેમોરહેજિક તાવ જેવા રોગો માટે સ્ત્રોત નિયંત્રણ વ્યૂહરચનાઓને સમર્થન આપતા વૈજ્ઞાનિક પુરાવા પૂરા પાડે છે.

પદ્ધતિસરની શક્તિઓ

મેટાજેનોમિક સિક્વન્સિંગ જાણીતા અને નવા બંને પ્રકારના રોગકારક જીવાણુઓની નિષ્પક્ષ શોધને સક્ષમ બનાવે છે.

આ અભ્યાસમાં, મેક્રો અને માઇક્રો-ટેસ્ટની પેથોજેન સંવર્ધન ટેકનોલોજીએ મજબૂત કામગીરી દર્શાવી, જટિલ જૈવિક નમૂનાઓમાં લક્ષ્ય પેથોજેન શોધને અસરકારક રીતે વધારી. પરિણામો વન્યજીવન દેખરેખમાં ઉચ્ચ-સંવેદનશીલતા પેથોજેન ઓળખને ટેકો આપવાની તેની ક્ષમતાની પુષ્ટિ કરે છે.

ઉત્પાદન ભલામણ

આ અભ્યાસમાં તેના સફળ ઉપયોગના આધારે, મેટ્રો અને માઇક્રો-ટેસ્ટ પેથોજેન આરએનએ એનરિચમેન્ટ કીટ મેટાજેનોમિક સર્વેલન્સ સંશોધન માટે ખૂબ ભલામણ કરવામાં આવે છે.

યજમાન ન્યુક્લિક એસિડને કાર્યક્ષમ રીતે ઘટાડીને અને માઇક્રોબાયલ સિક્વન્સને સમૃદ્ધ બનાવીને, કીટ શોધ સંવેદનશીલતા અને ડેટા ગુણવત્તામાં નોંધપાત્ર સુધારો કરે છે. તે જટિલ નમૂનાઓમાં ચોક્કસ રોગકારક શોધ માટે એક આવશ્યક સાધનનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે અને જાહેર આરોગ્ય દેખરેખ, ઝૂનોટિક જોખમ મૂલ્યાંકન અને ફાટી નીકળવાની તૈયારી માટે મજબૂત તકનીકી સહાય પૂરી પાડે છે.

Contact to learn more: marketing@mmtest.com